Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYP4F3Q08477 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms