Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms