Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms