Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms