Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4A11Q02928 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms