Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLCB3Q01970 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLCB3Q01970 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms