Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms