Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms