Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms