Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX1P83916 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX1P83916 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX1P83916 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX1P83916 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX1P83916 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBX1P83916 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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