Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1-1P60608 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFC1-1P60608 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms