Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME5P56597 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME5P56597 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME5P56597 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms