Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELLP55199 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELLP55199 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELLP55199 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms