Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms