Protein–RNA interactions for Protein: P54098

POLG, DNA polymerase subunit gamma-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLGP54098 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLGP54098 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLGP54098 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLGP54098 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLGP54098 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLGP54098 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLGP54098 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLGP54098 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLGP54098 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms