Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSBP53539 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOSBP53539 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms