Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP2P53365 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms