Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LUMP51884 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LUMP51884 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LUMP51884 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LUMP51884 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LUMP51884 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LUMP51884 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LUMP51884 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LUMP51884 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms