Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP4P49662 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP4P49662 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP4P49662 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP4P49662 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms