Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTPAP49638 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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