Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRPC1P48995 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms