Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNBP48739 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNBP48739 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms