Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF4P48230 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms