Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNCAP37840 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms