Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN2P35609 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms