Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD12P35452 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms