Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NF2P35240 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF2P35240 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF2P35240 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF2P35240 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NF2P35240 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NF2P35240 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NF2P35240 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NF2P35240 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NF2P35240 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NF2P35240 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NF2P35240 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms