Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC1P33527 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms