Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms