Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3AP31941 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms