Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms