Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLIP1P30622 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLIP1P30622 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms