Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLNP26678 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLNP26678 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PLNP26678 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLNP26678 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms