Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMLP26374 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms