Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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