Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2P22307 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2P22307 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCP2P22307 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2P22307 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCP2P22307 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms