Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB1P20618 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms