Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms