Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms