Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XBP1P17861 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XBP1P17861 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XBP1P17861 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms