Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB9P17482 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms