Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms