Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA4P13612 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA4P13612 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms