Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG2P13521 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG2P13521 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms