Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COX6A1P12074 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms