Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP2C9P11712 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms