Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms