Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRPA1P09661 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPA1P09661 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms