Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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