Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCCAP05165 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCCAP05165 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCCAP05165 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCAP05165 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCAP05165 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCAP05165 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms